承接英雄之种的故事委托之后，夏洛克·莱茵告别了他的助手瑞秋，只身来到伯拉勒斯，在这里，他组建了桅杆谜屋并试图以众人的智慧一起抗衡时空领主戴欧斯。
随着妮娜带来的第一个委托（破除暗影烈焰的诅咒），众人在西奥侦探的“推理”下踏上了雪林教堂，而可怕的怪事也在此发生，阴暗的人影，过去与现在的时间交错，而莱茵也在这场调查中困在了雪林教堂过去婚礼的时间线中，而另外一个已经被束缚不知多长岁月的莱茵代替了他的位置，重新出现在了众人面前。
随着第二场委托案的展开，阴谋也逐渐浮现，众人前往银松森林调查一夜消失的村落却被栽赃为凶手，并被指控上了法庭，而此时，更多不安的消息接连传来，莱茵失踪，远在伯拉勒斯的事务所被大火吞噬，众人怀着复杂的心情等待着审判日的到来。
法庭的审判日到来的异常迅速，幕后黑手威廉·布兰登作为公诉官指控众人在焚木村谋杀乔希·米雷斯特，令人意外的是，“麦斯米兰”作为污点证人出席指控桅杆谜屋的众人，就在众人即将获罪的时刻，失踪的莱茵出现，以认罪的形式揭穿了“麦斯米兰”的假身份，恼羞成怒的麦斯米兰（亚迪）在法庭上当场刺杀了莱茵，威廉被带走调查，并在之后面对了卡贝尔商会的指控。
桅杆谜屋的众人并不轻松，不论莱茵的罪行是否为真，但他的死已经成真，背负着罪名走向了死亡……